EC50 ve IC50: Aralarındaki fark

EC50 ve IC50 birbirine benziyor olsa da aynı soruyu yanıtlamaz. IC50, ölçülen bir sinyalin veya aktivitenin %50 oranında engellendiği konsantrasyonu ifade eder. EC50 ise, seçilen testte gözlemlenebilen maksimum etkinin %50'sine ulaşılan konsantrasyonu ifade eder. Dolayısıyla daha düşük bir değer ilk etapta yalnızca şunu ifade eder: tanımlanan %50 noktasına daha düşük bir konsantrasyonda ulaşılır. Bir bileşiğin daha iyi bağlanıp bağlanmadığı, daha büyük bir maksimum etkiye sahip olup olmadığı veya genel olarak daha üstün olup olmadığı, yalnızca EC50 veya IC50 değerlerinden güvenilir bir şekilde çıkarılmamalıdır. Diğer terimler Araştırma Sözlüğü'nde derlenmiştir.

Doz-yanıt eğrisinde bu iki ölçütün aslında neyi ölçtüğü

“%50 paylaşım” mantığı benzer görünse de farklı referans noktalarına atıfta bulunmaktadır. Doz serilerinin pratik planlaması için Peptid Seyreltme Hesaplayıcısı uygundur. Rekonstitüsyon Hesaplayıcısını kullanarak, konsantrasyonu kesin olarak belirlenmiş stok çözeltileri güvenli bir şekilde hazırlayın.

EC50 ve IC50 birbirinin yerine kullanılamadığında

EC50 ve IC50 değerleri, ancak bir sistem ilgili ölçüm aralığını tam olarak kapsadığında, yani tam inhibisyona veya belirgin bir maksimum etkiye kadar uzandığında birbirine yakın olabilir. Uygulamada ise durum genellikle böyle değildir. Kısmi bir agonist, maksimum etkisi tam bir agonistin etkisinin oldukça altında kalsa bile, net bir şekilde belirlenebilir bir EC50 değerine sahip olabilir. Tersine, bir inhibitör konsantrasyona bağlı bir şekilde inhibisyon gösterebilir ancak hiçbir zaman %50 eşiğinin altına düşmeyebilir; bu durumda bir IC50 değerinin rapor edilmesi metodolojik açıdan anlamlı değildir. Yorumlama açısından, potens ile etkinlik arasındaki ayrım çok önemlidir: düşük konsantrasyona ihtiyaç duyulması, büyük bir maksimum etkiye sahip olmakla aynı şey değildir. Doz serilerini oluşturmadan önce atılması gereken pratik adımlar, liyofilize ürünlerin sulandırılmasına ilişkin Kılavuzda özetlenmiştir : peptides.

Neden düşük değerler saf afiniteyi kanıtlamaz?

EC50 ve IC50, işlevsel ölçütlerdir. Bunlar, denge durumundaki bağlanmanın doğrudan ölçümünden değil, biyolojik veya biyokimyasal bir okumadan elde edilir. Düşük bir EC50 değeri, iyi hücre alımı, sinyal amplifikasyonu veya özellikle hassas bir model sistem sayesinde elde edilebilir. Düşük bir IC50 değeri ise substrat koşullarına ve test aralığına bağlı olabilir. Gerçek bağlanma gücü aranıyorsa, Kd veya Ki değerleri EC50 veya IC50'den farklı bir soruyu yanıtlar. Bu nedenle, karşılaştırmalar ancak test türü, son nokta, hedef sistem ve analiz koşulları yeterince benzer olduğunda güvenilirdir.

Hangi deneysel koşullar EC50 ve IC50 değerlerini değiştirir?

Deney düzenindeki küçük değişiklikler bile, bildirilen %50 değerini belirgin şekilde değiştirebilir. Buna yarı ömür ve deney tasarımı da dahildir.

• Özellikle IC50 değeri, inhibisyon mekanizması ve substrat konsantrasyonundan büyük ölçüde etkilenir. Aynı inhibitör, deney düzenine bağlı olarak daha zayıf ya da daha güçlü etki gösterebilir.
• Eğri modeli, uyum sınırları ve normalleştirme, %50 olarak bildirilen noktayı kaydırır. Göreceli ve mutlak analizler her zaman aynı izlenimi vermez.
• Kontroller ve sinyal aralığı, üst ve alt seviyelerin nerede olduğunu ve orta noktanın ne kadar net bir şekilde hesaplanabileceğini belirlemeye yardımcı olur.
• Sıkı bağlanma durumlarında veya yüksek hedef konsantrasyonlarda, görünen inhibisyon gücü çarpıtılabilir.
• Enzim, hücre ve in vivo modellerinden elde edilen değerler doğrudan eşdeğer değildir; zira taşıma, dağılım ve sistem tepkisi ek etkiler yaratmaktadır.

Araştırmalarda EC50 ve IC50 değerlerini nasıl bağlam içine yerleştiriyoruz?

24Peptides ’da, malzeme kalitesini biyolojik etkinliğin dışında tutmayı bilinçli olarak tercih ediyoruz. COA’mız ve kalite içeriğimiz, HPLC, LC-MS ve kontaminasyon kontrolleri gibi analitik verilere dayanmaktadır. Her parti, kimlik, saflık, endotoksinler, biyoyük ve ağır metaller dahil olmak üzere bağımsız olarak test edilir ve parti bazında belgelenir. Bu tür kanıtlar, kimlik, saflık ve biyoyük ile ilgili soruları ele alır. Buna karşılık, EC50 ve IC50 değerleri, test yöntemine bağlı etkileri tanımlar ve yalnızca model, kontrol sistemi ve okuma sonuçlarıyla birlikte anlamlıdır. Araştırma peptides açısından bunlar, aynı araştırma çalışmasının birbirinden farklı ancak birbirini tamamlayan iki katmanıdır.

Çalışmalarda sıklıkla bir arada geçen terimler: Kd, Ki, ED50 ve LD50

Sayılar karşılaştırılmadan önce, bir çalışmanın bağlanma, inhibisyon, etki mi yoksa uygulanan dozu mu ölçtüğü her zaman net olmalıdır.